Σε αυτή την εργασία εισάγονται δύο βασικά αμινοξέα, γλυκίνη (Gly) και Alanine (ALA). Αυτό οφείλεται κυρίως στο γεγονός ότι μπορούν να λειτουργήσουν ως βασικά αμινοξέα και η προσθήκη ομάδων σε αυτά μπορούν να δημιουργήσουν άλλα είδη αμινοξέων.
Η γλυκίνη έχει μια ειδική γλυκιά γεύση, οπότε το αγγλικό της όνομα προέρχεται από το ελληνικό glykys (γλυκό). Η κινεζική μετάφραση της γλυκίνης όχι μόνο έχει την έννοια του "γλυκού", αλλά έχει και την παρόμοια προφορά, η οποία μπορεί να ονομαστεί μοντέλο "πιστότητας, επίτευξης και κομψότητας". Λόγω της γλυκιάς του γεύσης, η γλυκίνη χρησιμοποιείται συχνά ως αρωματικός παράγοντας στη βιομηχανία τροφίμων για την απομάκρυνση της πικρίας και την αύξηση της γλυκύτητας. Η πλευρική αλυσίδα της γλυκίνης είναι μικρή με μόνο ένα άτομο υδρογόνου. Αυτό τον κάνει διαφορετικό. Είναι ένα βασικό αμινοξέο χωρίς χειροποίητη.
Η γλυκίνη σε πρωτεΐνες χαρακτηρίζεται από το μικρό μέγεθος και την ευελιξία της. Για παράδειγμα, η διαμόρφωση τριών έλικας του κολλαγόνου είναι πολύ ξεχωριστή. Πρέπει να υπάρχει μία γλυκίνη για κάθε δύο υπολείμματα, διαφορετικά θα προκαλέσει υπερβολική στερεότητα. Ομοίως, η σύνδεση μεταξύ δύο τομέων μιας πρωτεΐνης συχνά απαιτεί γλυκίνη για την παροχή ευελιξίας διαμόρφωσης. Ωστόσο, εάν η γλυκίνη είναι αρκετά ευέλικτη, η σταθερότητά της είναι αναγκαστικά ανεπαρκής.
Η γλυκίνη είναι ένας από τους spoilers κατά τη διάρκεια του σχηματισμού α-έλικας. Ο λόγος είναι ότι οι πλευρικές αλυσίδες είναι πολύ μικρές για να σταθεροποιήσουν καθόλου τη διαμόρφωση. Επιπλέον, η γλυκίνη χρησιμοποιείται συχνά για την παρασκευή λύσεων buffer. Εκείνοι από εσάς που κάνετε ηλεκτροφόρηση συχνά το θυμάστε αυτό.
Το αγγλικό όνομα της Alanine προέρχεται από τη γερμανική ακεταλδεΰδη και το κινεζικό όνομα είναι ευκολότερο να κατανοηθεί επειδή η Alanine περιέχει τρεις άνθρακες και το χημικό της όνομα είναι αλανίνη. Αυτό είναι ένα απλό όνομα, όπως και ο χαρακτήρας του αμινοξέος. Η πλευρική αλυσίδα της αλανίνης έχει μόνο μία ομάδα μεθυλίου και είναι ελαφρώς μεγαλύτερη από αυτή της γλυκίνης. Όταν έβγαλα τους δομικούς τύπους για τα άλλα 18 αμινοξέα, πρόσθεσα ομάδες στην Alanine. Στις πρωτεΐνες, η αλανίνη είναι σαν ένα τούβλο, ένα κοινό βασικό δομικό υλικό που δεν έρχεται σε αντίθεση με κανέναν.
Η πλευρική αλυσίδα της αλανίνης έχει ελάχιστα εμπόδιο και βρίσκεται στην α-έλικα, η οποία είναι μια διαμόρφωση. Είναι επίσης πολύ σταθερό όταν β-δίπλα. Στη μηχανική πρωτεϊνών, εάν θέλετε να μεταλλαχθείτε ένα αμινοξύ χωρίς συγκεκριμένο στόχο σε μια πρωτεΐνη, μπορείτε γενικά να το μεταλλάξετε σε αλανίνη, η οποία δεν είναι εύκολο να καταστρέψει τη συνολική διαμόρφωση της πρωτεΐνης.
Χρόνος δημοσίευσης: 2025-07-02