Σε αυτή την εργασία, εισάγονται δύο βασικά αμινοξέα, η γλυκίνη (Gly) και η αλανίνη (Ala).Αυτό οφείλεται κυρίως στο ότι μπορούν να λειτουργήσουν ως βασικά αμινοξέα και η προσθήκη ομάδων σε αυτά μπορεί να δημιουργήσει άλλα είδη αμινοξέων.
Η γλυκίνη έχει μια ιδιαίτερη γλυκιά γεύση, επομένως το αγγλικό της όνομα προέρχεται από το ελληνικό glykys (sweet).Η κινεζική μετάφραση της γλυκίνης δεν έχει μόνο την έννοια του «γλυκού», αλλά έχει και την παρόμοια προφορά, η οποία μπορεί να ονομαστεί το μοντέλο της «πιστότητας, του επιτεύγματος και της κομψότητας».Λόγω της γλυκιάς γεύσης της, η γλυκίνη χρησιμοποιείται συχνά ως αρωματικός παράγοντας στη βιομηχανία τροφίμων για την αφαίρεση της πικρίας και την αύξηση της γλυκύτητας.Η πλευρική αλυσίδα της γλυκίνης είναι μικρή με ένα μόνο άτομο υδρογόνου.Αυτό τον κάνει διαφορετικό.Είναι ένα βασικό αμινοξύ χωρίς χειραλικότητα.
Η γλυκίνη στις πρωτεΐνες χαρακτηρίζεται από το μικρό της μέγεθος και την ευελιξία της.Για παράδειγμα, η διαμόρφωση τρίκλωνης έλικας του κολλαγόνου είναι πολύ ιδιαίτερη.Πρέπει να υπάρχει μία γλυκίνη για κάθε δύο υπολείμματα, διαφορετικά θα προκαλέσει υπερβολική στερική παρεμπόδιση.Ομοίως, η σύνδεση μεταξύ δύο περιοχών μιας πρωτεΐνης συχνά απαιτεί γλυκίνη για να παρέχει ευελιξία διαμόρφωσης.Ωστόσο, εάν η γλυκίνη είναι αρκετά εύκαμπτη, η σταθερότητά της είναι αναγκαστικά ανεπαρκής.
Η γλυκίνη είναι ένα από τα σπόιλερ κατά τον σχηματισμό της α-έλικας.Ο λόγος είναι ότι οι πλευρικές αλυσίδες είναι πολύ μικρές για να σταθεροποιήσουν καθόλου τη διαμόρφωση.Επιπλέον, η γλυκίνη χρησιμοποιείται συχνά για την παρασκευή ρυθμιστικών διαλυμάτων.Όσοι από εσάς κάνετε ηλεκτροφόρηση το θυμάστε συχνά.
Η αγγλική ονομασία της αλανίνης προέρχεται από τη γερμανική ακεταλδεΰδη και η κινεζική ονομασία είναι πιο κατανοητή επειδή η αλανίνη περιέχει τρεις άνθρακες και η χημική της ονομασία είναι αλανίνη.Αυτό είναι ένα απλό όνομα, όπως και ο χαρακτήρας του αμινοξέος.Η πλευρική αλυσίδα της αλανίνης έχει μόνο μία ομάδα μεθυλίου και είναι ελαφρώς μεγαλύτερη από αυτή της γλυκίνης.Όταν σχεδίασα τους δομικούς τύπους για τα άλλα 18 αμινοξέα, πρόσθεσα ομάδες στην αλανίνη.Στις πρωτεΐνες, η αλανίνη είναι σαν τούβλο, ένα κοινό βασικό δομικό υλικό που δεν έρχεται σε αντίθεση με κανέναν.
Η πλευρική αλυσίδα της αλανίνης έχει μικρό εμπόδιο και βρίσκεται στην α-έλικα, η οποία είναι μια διαμόρφωση.Είναι επίσης πολύ σταθερό όταν β-διπλώνεται.Στη μηχανική πρωτεϊνών, εάν θέλετε να μεταλλάξετε ένα αμινοξύ χωρίς συγκεκριμένο στόχο σε μια πρωτεΐνη, μπορείτε γενικά να το μεταλλάξετε σε αλανίνη, κάτι που δεν είναι εύκολο να καταστραφεί η συνολική διαμόρφωση της πρωτεΐνης.
Ώρα δημοσίευσης: 29 Μαΐου 2023