Σχέδιο σχεδιασμού και λύση πολυπεπτιδικής αλυσίδας πεπτιδίων

I. Περίληψη
Τα πεπτίδια είναι ειδικά μακρομόρια έτσι ώστε οι ακολουθίες τους να είναι ασυνήθιστες στα χημικά και φυσικά χαρακτηριστικά τους. Ορισμένα πεπτίδια είναι δύσκολο να συνθέσουν, ενώ άλλα είναι σχετικά εύκολο να συνθέσουν αλλά είναι δύσκολο να καθαριστούν. Το πρακτικό πρόβλημα είναι ότι τα περισσότερα πεπτίδια είναι ελαφρώς διαλυτά σε υδατικά διαλύματα, έτσι ώστε στον καθαρισμό μας, το αντίστοιχο τμήμα του υδρόφοβου πεπτιδίου πρέπει να διαλύεται αυστηρά σε μη υδατικά διαλύτες, επομένως αυτοί οι διαλύτες ή οι ρυθμιστές είναι πιθανό να είναι σοβαρά ασυνεπές με τη χρήση των βιολογικών πειραματικών διαδικασιών, έτσι ώστε οι τεχνικοί, έτσι ώστε να είναι οι ακόλουθοι, έτσι ώστε να είναι οι ακόλουθοι, έτσι ώστε οι τεχνικοί, έτσι ώστε να είναι οι ακόλουθοι, έτσι ώστε οι τεχνικοί, έτσι ώστε να είναι οι ακόλουθοι, έτσι ώστε οι τεχνικοί, έτσι ώστε να είναι οι ακίνητοι, έτσι ώστε να είναι οι ακόλουθοι. Αρκετές πτυχές του σχεδιασμού πεπτιδίων για τους ερευνητές.

Σχέδιο σχεδιασμού και λύση πολυπεπτιδικής αλυσίδας πεπτιδίων
Δεύτερον, η σωστή επιλογή συνθετικών δύσκολων πεπτιδίων
1. Συνολικό μήκος μειωμένων αλληλουχιών
Τα πεπτίδια μικρότερων από 15 υπολείμματα είναι ευκολότερο να ληφθούν επειδή το μέγεθος του πεπτιδίου αυξάνεται και η καθαρότητα του ακατέργαστου προϊόντος μειώνεται. Καθώς το συνολικό μήκος της πεπτιδικής αλυσίδας αυξάνεται πέρα ​​από 20 υπολείμματα, η ακριβής ποσότητα του προϊόντος αποτελεί βασική ανησυχία. Σε πολλά πειράματα, είναι εύκολο να ληφθούν απροσδόκητα αποτελέσματα μειώνοντας τον αριθμό υπολειμμάτων κάτω των 20.
2. Μειώστε τον αριθμό των υδρόφοβων υπολειμμάτων
Τα πεπτίδια με μεγάλη κυριαρχία υδρόφοβων υπολειμμάτων, ειδικά στην περιοχή 7-12 υπολείμματα από το C-τελικό άκρο, προκαλούν συνήθως συνθετικές δυσκολίες. Αυτό θεωρείται ως ανεπαρκής συνδυασμός ακριβώς επειδή λαμβάνεται ένα φύλλο B-Fold στη σύνθεση. "Σε τέτοιες περιπτώσεις, μπορεί να είναι χρήσιμο να μετατρέψουμε περισσότερα από δύο θετικά και αρνητικά υπολείμματα ή να τοποθετήσουμε Gly ή Pro στο πεπτίδιο για να ξεκλειδώσετε τη σύνθεση πεπτιδίων".
3. Down ρύθμιση των "δύσκολων" υπολειμμάτων
"Υπάρχει ένας αριθμός Cys, Met, Arg, και δοκιμάστε υπολείμματα που γενικά δεν συντίθενται εύκολα." Το SER θα χρησιμοποιείται συνήθως ως μη οξειδωτική εναλλακτική λύση στο CYS.
Σχέδιο σχεδιασμού και λύση πολυπεπτιδικής αλυσίδας πεπτιδίων

Τρίτον, βελτιώστε τη σωστή επιλογή διαλυτών στο νερό
1. Ρυθμίστε το άκρο n ή c
Σχετικά με τα όξινα πεπτίδια (δηλαδή, συνιστάται ιδιαίτερα η ακετυλίωση (Ν-τελική ακετυλίωση, το άκρο C διατηρώντας πάντα μια ελεύθερη καρβοξυλική ομάδα) συνιστάται ιδιαίτερα για την αύξηση του αρνητικού φορτίου. Ωστόσο, για τα βασικά πεπτίδια (δηλαδή, φορτίζονται θετικά σε ρΗ 7), συνιστάται ιδιαίτερα η αμινόμηση (ελεύθερη αμινομάδα στο Ν-τελικό άκρο και η αμινόμηση στο C-τελικό άκρο) για την αύξηση του θετικού φορτίου.

2. Μειώστε πολύ ή επιμηκύνετε την ακολουθία

Ορισμένες από τις αλληλουχίες περιέχουν μεγάλο αριθμό υδρόφοβων αμινοξέων, όπως TRP, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr και ALA, κλπ. Όταν αυτά τα υδρόφοβα υπολείμματα υπερβαίνουν το 50%, συνήθως δεν είναι εύκολο να διαλυθούν. Μπορεί να είναι χρήσιμο να επιμηκυνθεί η ακολουθία για περαιτέρω αύξηση των θετικών και αρνητικών πόλων του πεπτιδίου. Η δεύτερη επιλογή είναι να ρυθμίσετε προς τα κάτω το μέγεθος της πεπτιδίου αλυσίδας για να αυξήσετε τους θετικούς και αρνητικούς πόλους με την καθοδήγηση των υδρόφοβων υπολειμμάτων. Όσο ισχυρότερη είναι η θετική και η αρνητική πλευρά της πεπτιδικής αλυσίδας, τόσο πιο πιθανό είναι να αντιδράσει με το νερό.
3. Βάλτε σε υδατοδιαλυτά υπόλειμμα
Για ορισμένες πεπτιδικές αλυσίδες, ο συνδυασμός ορισμένων θετικών και αρνητικών αμινοξέων μπορεί να βελτιώσει την υδατοδιαλυτότητα. Η εταιρεία μας συνιστά το Ν-τελικό άκρο ή το C-τελικό άκρο των όξινων πεπτιδίων να συνδυαστούν με Glu-Glu. Το N ή C άκρο του βασικού πεπτιδίου δόθηκε και στη συνέχεια Lys-Lys. Εάν η φορτισμένη ομάδα δεν μπορεί να τοποθετηθεί, το Ser-Gly-Ser μπορεί επίσης να τοποθετηθεί στο άκρο Ν ή Γ. Ωστόσο, αυτή η προσέγγιση δεν λειτουργεί όταν οι πλευρές της αλυσίδας πεπτιδίων δεν μπορούν να αλλάξουν.