Τέσσερα χαρακτηριστικά των αντιμικροβιακών πεπτιδίων

Αυτά τα αντιμικροβιακά πεπτίδια προήλθαν αρχικά από τα αμυντικά συστήματα εντόμων, θηλαστικών, αμφιβίων κ.λπ., και περιλαμβάνουν κυρίως τέσσερις κατηγορίες:

1. Η κεκροπίνη ήταν αρχικά παρούσα στην ανοσολογική λέμφο της Κεκροπιαμώθ, η οποία βρίσκεται κυρίως σε άλλα έντομα, και παρόμοια βακτηριοκτόνα πεπτίδια βρίσκονται επίσης στα έντερα των χοίρων.Χαρακτηρίζονται τυπικά από μια ισχυρά αλκαλική Ν-τερματική περιοχή ακολουθούμενη από ένα μακρύ υδρόφοβο θραύσμα.

2. Τα αντιμικροβιακά πεπτίδια Xenopus (magainin) προέρχονται από τους μύες και το στομάχι των βατράχων.Η δομή των αντιμικροβιακών πεπτιδίων xenopus βρέθηκε επίσης να είναι ελικοειδής, ειδικά σε υδρόφοβα περιβάλλοντα.Η διαμόρφωση των αντιπεπτιδίων xenopus σε λιπιδικές στοιβάδες μελετήθηκε με Ν-σημασμένο NMR στερεάς φάσης.Με βάση τη χημική μετατόπιση του συντονισμού ακυλαμίνης, οι έλικες των αντιπεπτιδίων xenopus ήταν παράλληλες επιφάνειες διπλής στιβάδας και μπορούσαν να συγκλίνουν για να σχηματίσουν ένα κλουβί 13 mm με περιοδική ελικοειδή δομή 30 mm.

3. Τα πεπτίδια άμυνας defensin προέρχονται από ανθρώπινα πολυκαρυωτικά ουδετερόφιλα πολυμακροφάγα κουνελιού με πλήρη πυρηνικό λοβό και εντερικά κύτταρα ζώων.Μια ομάδα αντιμικροβιακών πεπτιδίων παρόμοια με τα αμυντικά πεπτίδια των θηλαστικών εξήχθη από έντομα, που ονομάζονται «πεπτίδια άμυνας εντόμων».Σε αντίθεση με τα αμυντικά πεπτίδια των θηλαστικών, τα πεπτίδια άμυνας των εντόμων είναι ενεργά μόνο έναντι των θετικών κατά Gram βακτηρίων.Ακόμη και τα πεπτίδια άμυνας εντόμων περιέχουν έξι υπολείμματα Cys, αλλά η μέθοδος δισουλφιδικής σύνδεσης μεταξύ τους είναι διαφορετική.Ο τρόπος δέσμευσης ενδομοριακής δισουλφιδικής γέφυρας των αντιβακτηριακών πεπτιδίων που εξάγονται από το Drosophila melanogast ήταν παρόμοιος με αυτόν των πεπτιδίων φυτικής άμυνας.Υπό κρυσταλλικές συνθήκες, τα αμυντικά πεπτίδια παρουσιάζονται ως διμερή.

4. Η ταχυπλεσίνη προέρχεται από πεταλοειδή καβούρια, που ονομάζονται πεταλοκαβούρι.Οι μελέτες διαμόρφωσης δείχνουν ότι υιοθετεί μια αντιπαράλληλη αναδίπλωση Β (3-8 θέσεις, 11-16 θέσεις), στην οποίαβΗ γωνία συνδέεται μεταξύ τους (8-11 θέσεις) και δημιουργούνται δύο δισουλφιδικοί δεσμοί μεταξύ των θέσεων 7 και 12 και μεταξύ των θέσεων 3 και 16.Σε αυτή τη δομή, το υδρόφοβο αμινοξύ βρίσκεται στη μία πλευρά του επιπέδου και τα έξι κατιονικά υπολείμματα εμφανίζονται στην ουρά του μορίου, επομένως η δομή είναι επίσης βιοφιλική.

Από αυτό προκύπτει ότι σχεδόν όλα τα αντιμικροβιακά πεπτίδια είναι κατιονικής φύσης, παρόλο που ποικίλλουν σε μήκος και ύψος.Στο υψηλό τέλος, είτε με τη μορφή άλφα-ελικοειδούς είτεβ-η αναδιπλούμενη, διτροπική δομή είναι το κοινό χαρακτηριστικό.