Αυτά τα αντιμικροβιακά πεπτίδια προέρχονταν αρχικά από τα αμυντικά συστήματα εντόμων, θηλαστικών, αμφιβίων κ.λπ. και περιλαμβάνουν κυρίως τέσσερις κατηγορίες:
1. Το Cecropin ήταν αρχικά παρόν στο ανοσοποιητικό λεμφικό του Cecropiamoth, η οποία βρίσκεται κυρίως σε άλλα έντομα και παρόμοια βακτηριοκτόνα πεπτίδια βρίσκονται επίσης στα έντερα του χοίρου. Συνήθως χαρακτηρίζονται από μια έντονα αλκαλική Ν-τερματική περιοχή που ακολουθείται από ένα μακρύ υδρόφοβο θραύσμα.
2. Τα αντιμικροβιακά πεπτίδια Xenopus (magainin) προέρχονται από τους μύες και το στομάχι των βατράχων. Η δομή των αντιμικροβιακών πεπτιδίων Xenopus βρέθηκε επίσης ελικοειδές, ειδικά σε υδρόφοβα περιβάλλοντα. Η διαμόρφωση των αντιτοπεπτιδίων Xenopus σε στρώματα λιπιδίων μελετήθηκε με ΝΜΡ στερεάς φάσης με επισημασμένη με Ν. Με βάση τη χημική μετατόπιση του συντονισμού της ακυλαμίνης, οι έλικες των αντιτοπεπτιδίων Xenopus ήταν παράλληλες επιφάνειες διπλοστοιβάδας και θα μπορούσαν να συγκλίνουν για να σχηματίσουν ένα κλουβί 13 mm με περιοδική ελικοειδή δομή 30mm.
3. Τα πεπτίδια αμυντικής αμυντικής προέρχονται από πολυμακροφάγα ανθρώπινου πολυκαρτικού ουδετερόφιλου με πλήρη πυρηνικό λοβό και εντερικά κύτταρα ζώων. Μία ομάδα αντιμικροβιακών πεπτιδίων παρόμοια με τα αμυντικά πεπτίδια θηλαστικών εκχυλίστηκε από έντομα, που ονομάζεται "πεπτίδια άμυνας εντόμων". Σε αντίθεση με τα πεπτίδια άμυνας των θηλαστικών, τα πεπτίδια άμυνας των εντόμων είναι ενεργά μόνο έναντι Gram-θετικών βακτηρίων. Ακόμη και τα πεπτίδια άμυνας των εντόμων περιέχουν έξι υπολείμματα Cys, αλλά η μέθοδος της σύνδεσης δισουλφιδίου μεταξύ τους είναι διαφορετική. Ο τρόπος δέσμευσης ενδομοριακής δισουλφιδικής γέφυρας των αντιβακτηριακών πεπτιδίων που εξάγονται από Drosophila melanogast ήταν παρόμοια με εκείνη των πεπτιδίων άμυνας των φυτών. Υπό κρυστάλλινες συνθήκες, τα αμυντικά πεπτίδια παρουσιάζονται ως διμερή.
4. Το Tachyplesin προέρχεται από καβούρια πετάλων, που ονομάζεται Horseshoecrab. Οι μελέτες διαμόρφωσης δείχνουν ότι υιοθετεί μια αντιπαράλληλη διαμόρφωση B-διπλώματος (3-8 θέσεις, 11-16 θέσεις), στις οποίες β-Agker συνδέεται μεταξύ τους (8-11 θέσεις) και δημιουργούνται δύο δεσμοί δισουλφιδίου μεταξύ των 7 και 12 θέσεων και μεταξύ των 3 και 16 θέσεων. Σε αυτή τη δομή, το υδρόφοβο αμινοξύ βρίσκεται στη μία πλευρά του επιπέδου και τα έξι κατιονικά υπολείμματα εμφανίζονται στην ουρά του μορίου, οπότε η δομή είναι επίσης βιοφιλική.
Επομένως, σχεδόν όλα τα αντιμικροβιακά πεπτίδια είναι κατιονικά στη φύση, παρόλο που ποικίλλουν σε μήκος και ύψος. Στο υψηλό τέλος, είτε με τη μορφή άλφα-ελικοειδούς είτε β-Η δομή του Bitropic είναι το κοινό χαρακτηριστικό.
Χρόνος δημοσίευσης: 2025-07-03