Τι είναι τα πεπτίδια που διεισδύουν στα κύτταρα;

Τα πεπτίδια που διεισδύουν στα κύτταρα είναι μικρά πεπτίδια που μπορούν εύκολα να διεισδύσουν στην κυτταρική μεμβράνη.Αυτή η κατηγορία μορίων, ειδικά CPP με λειτουργίες στόχευσης, υπόσχεται αποτελεσματική παροχή φαρμάκου στα κύτταρα-στόχους.

Επομένως, η έρευνα σχετικά με αυτό έχει κάποια βιοϊατρική σημασία.Σε αυτή τη μελέτη, CPPs με διαφορετικές διαμεμβρανικές δραστηριότητες μελετήθηκαν σε επίπεδο αλληλουχίας, προσπαθώντας να ανακαλύψουν τους παράγοντες που επηρεάζουν τη διαμεμβρανική δραστηριότητα των CPPs, τις διαφορές αλληλουχίας μεταξύ CPPs με διαφορετικές δραστηριότητες και NonCPPs, και να εισαγάγουν μια μέθοδο για την ανάλυση βιολογικών αλληλουχιών.

Οι αλληλουχίες CPPs και NonCPPs ελήφθησαν από τη βάση δεδομένων CPPsite και διαφορετικές βιβλιογραφίες και τα διαμεμβρανικά πεπτίδια (HCPPs, MCPPs, LCPPs) με υψηλή, μέση και χαμηλή διαμεμβρανική δραστικότητα εξήχθησαν από τις αλληλουχίες CPPs για την κατασκευή συνόλων δεδομένων.Με βάση αυτά τα σύνολα δεδομένων, πραγματοποιήθηκαν οι ακόλουθες μελέτες:

1, Η σύνθεση αμινοξέων και δευτεροταγούς δομής διαφορετικών δραστικών CPPs και NonCPPs αναλύθηκαν με ANOVA.Διαπιστώθηκε ότι οι ηλεκτροστατικές και υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις των αμινοξέων έπαιξαν σημαντικό ρόλο στη διαμεμβρανική δραστηριότητα των CPP και η ελικοειδής δομή και η τυχαία περιέλιξη επηρέασαν επίσης τη διαμεμβρανική δραστηριότητα των CPP.

2. Οι φυσικές και χημικές ιδιότητες και τα μήκη των CPP με διαφορετικές δραστηριότητες εμφανίστηκαν στο δισδιάστατο επίπεδο.Διαπιστώθηκε ότι τα CPP και τα NonCPP με διαφορετικές δραστηριότητες μπορούσαν να ομαδοποιηθούν σε ορισμένες ειδικές ιδιότητες και τα HCPP, MCPP, LCPP και NonCPP χωρίστηκαν σε τρεις ομάδες, δείχνοντας τις διαφορές τους.

3. Σε αυτή την εργασία, εισάγεται η έννοια του φυσικού και χημικού κέντρου της βιολογικής αλληλουχίας, και τα υπολείμματα που συνθέτουν την αλληλουχία θεωρούνται ως σημεία σωματιδίων και η ακολουθία αφαιρείται ως σύστημα σωματιδίων για έρευνα.Αυτή η μέθοδος εφαρμόστηκε στην ανάλυση των CPP προβάλλοντας CPP με διαφορετικές δραστηριότητες στο τρισδιάστατο επίπεδο με τη μέθοδο PCA και βρέθηκε ότι τα περισσότερα CPP συγκεντρώθηκαν μαζί και μερικά LCPP συγκεντρώθηκαν μαζί με τα NonCPP.

Αυτή η μελέτη έχει επιπτώσεις στον σχεδιασμό των CPP και στην κατανόηση των διαφορών στις αλληλουχίες των CPPs με διαφορετικές δραστηριότητες.Επιπλέον, η μέθοδος ανάλυσης του φυσικού και χημικού κέντρου βιολογικών αλληλουχιών που εισάγεται σε αυτή την εργασία μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την ανάλυση άλλων βιολογικών προβλημάτων.Ταυτόχρονα, μπορούν να χρησιμοποιηθούν ως παράμετροι εισόδου για ορισμένα προβλήματα βιολογικής ταξινόμησης και να παίξουν ρόλο στην αναγνώριση προτύπων.