Τα πεπτίδια διείσδυσης κυττάρων είναι μικρά πεπτίδια που μπορούν εύκολα να διεισδύσουν στην κυτταρική μεμβράνη. Αυτή η κατηγορία μορίων, ειδικά CPPs με λειτουργίες στόχευσης, έχει υπόσχεση για αποτελεσματική χορήγηση φαρμάκων σε κύτταρα στόχου.
Ως εκ τούτου, η έρευνα για αυτό έχει κάποια βιοϊατρική σημασία. Σε αυτή τη μελέτη, CPP με διαφορετικές διαμεμβρανικές δραστηριότητες μελετήθηκαν στο επίπεδο αλληλουχίας, προσπαθώντας να διαπιστωθεί οι παράγοντες που επηρεάζουν τη διαμεμβρανική δραστικότητα των CPPs, τις διαφορές αλληλουχίας μεταξύ CPP με διαφορετικές δραστηριότητες και μη CPPs και εισάγουν μια μέθοδο ανάλυσης βιολογικών αλληλουχιών.
Οι αλληλουχίες CPPS και μη CPPs ελήφθησαν από τη βάση δεδομένων CPPSITE και διαφορετικές βιβλιογραφίες και διαμεμβρανικά πεπτίδια (HCPPS, MCPPS, LCPPS) με υψηλά, μέτρια και χαμηλή διαμεμβρανική δραστικότητα εξήχθησαν από τις αλληλουχίες CPPS για την κατασκευή συνόλων δεδομένων. Με βάση αυτά τα σύνολα δεδομένων, διεξήχθησαν οι ακόλουθες μελέτες:
1, η σύνθεση αμινοξέων και δευτερογενούς δομής των διαφορετικών δραστικών CPPs και NonCPPs αναλύθηκαν από την ANOVA. Διαπιστώθηκε ότι οι ηλεκτροστατικές και υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις των αμινοξέων διαδραμάτισαν σημαντικό ρόλο στη διαμεμβρανική δραστικότητα των CPPs και η ελικοειδής δομή και η τυχαία συγκόλληση επηρέασαν επίσης τη διαμεμβρανική δραστικότητα των CPPs.
2. Οι φυσικές και χημικές ιδιότητες και τα μήκη των CPP με διαφορετικές δραστηριότητες εμφανίστηκαν στο δισδιάστατο επίπεδο. Διαπιστώθηκε ότι οι CPP και οι μη CPPs με διαφορετικές δραστηριότητες θα μπορούσαν να συγκεντρωθούν κάτω από ορισμένες ειδικές ιδιότητες και τα HCPPs, MCPPs, LCPPs και NonCPP διαιρέθηκαν σε τρεις συστάδες, δείχνοντας τις διαφορές τους.
3 Σε αυτή την εργασία εισάγεται η έννοια του φυσικού και χημικού κεντροειδούς της βιολογικής αλληλουχίας και τα υπολείμματα που συνθέτουν την αλληλουχία θεωρούνται ως σημεία σωματιδίων και η αλληλουχία αντλείται ως σύστημα σωματιδίων για έρευνα. Αυτή η μέθοδος εφαρμόστηκε στην ανάλυση των CPPs με την προβολή CPP με διαφορετικές δραστηριότητες στο 3D επίπεδο με τη μέθοδο PCA και διαπιστώθηκε ότι οι περισσότεροι CPP έχουν συσσωρευτεί μαζί και μερικά LCPPs συσσωματώθηκαν μαζί με NONCPPs.
Η μελέτη αυτή έχει επιπτώσεις για το σχεδιασμό CPP και την κατανόηση των διαφορών στις ακολουθίες των CPP με διαφορετικές δραστηριότητες. Επιπλέον, η μέθοδος ανάλυσης φυσικών και χημικών κεντροειδών βιολογικών αλληλουχιών που εισάγονται σε αυτό το έγγραφο μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την ανάλυση άλλων βιολογικών προβλημάτων. Ταυτόχρονα, μπορούν να χρησιμοποιηθούν ως παραμέτρους εισόδου για ορισμένα προβλήματα βιολογικής ταξινόμησης και να διαδραματίσουν κάποιο ρόλο στην αναγνώριση προτύπων.
Χρόνος δημοσίευσης: 2025-07-02